药物治疗具有起效较快、疗效确切的特点，适用于中重度抑郁症患者。抗抑郁药是目前治疗各种抑郁症的主要药物，能有效缓解抑郁情绪及伴随的焦虑、紧张和躯体症状，有效率约为60% ~ 80%。 目前，一线抗抑郁药包括抗抑郁药，如帕罗西汀、舍曲林、氟西汀、西酞普兰、氟伏沙明等。俗称“五朵金花”。SSRI不良反应少且轻微，尤其是抗胆碱能和心脏不良反应。常见的不良反应包括恶心、呕吐、厌食、便秘、腹泻、口干、震颤、失眠、焦虑和性功能障碍。SNRI药，如文拉法辛和度洛西汀，疗效确切，见效快，抗抑郁和抗焦虑作用明显。对难治性病例也有效。常见的不良反应包括恶心、口干、出汗、疲劳、焦虑、震颤、阳痿和射精障碍。一些患者的血压在大剂量时可能会轻微升高。NaSSAs(去甲肾上腺素和特异性5-羟色胺抗抑郁药)，如米氮平，具有良好的抗抑郁、抗焦虑和改善睡眠的作用。口服吸收快，见效快，抗胆碱能作用小，有镇静作用，对性功能影响小。常见的不良反应是镇静、嗜睡、头晕、疲劳、食欲和体重增加。苯丙胺是去甲肾上腺素、血清素和多巴胺再摄取的弱抑制剂，对单胺氧化酶无抑制作用，适用于抑郁症和双相抑郁症，对体重和性功能影响小。常见的不良反应包括：兴奋、口干、失眠、头痛或偏头痛、恶心、呕吐、便秘、震颤、多汗。 对于一些有明显焦虑和睡眠障碍的患者，可以短期使用一些苯二氮卓类药物或一些新的睡眠辅助药物，如唑吡坦和佐匹克隆。对于一些有严重症状甚至精神病症状的患者，可以联合使用抗精神病药物进行治疗。